Петдесет години въпрос, две години отговор
AlphaFold и проблемът за сгъването на белтъците. Какво е решено и какво още не.
Белтъците са като наниз от мъниста, който се свива на топка по свой начин. Учените десетилетия се опитвали да познаят формата само от реда на мънистата. Компютърна програма се научи да я познава много добре.
01Какво направиха
Белтъците са вериги от аминокиселини, които се сгъват в точна триизмерна форма. Формата определя какво прави белтъкът, а експерименталното ѝ определяне може да отнеме месеци.
На слепия тест CASP14 през 2020 г. AlphaFold 2 постига точност, сравнима с експерименталните структури в повечето случаи¹.¹ Бележка
„Сляп тест“ значи, че верните отговори не са били публични по време на състезанието.
02Какво остава
Това не „решава биологията“: движението на белтъците, взаимодействията им и ефектите на мутации остават отворени въпроси.
Присъда · доказано / недоказано
по източник [1]- Предсказанията са близки до експерименталните за повечето цели
- Резултатът е независимо проверен в слепия тест
- Че статичната форма обяснява как белтъкът работи в клетката
- Че подобен скок предстои във всяка наука
- 1 · Само идея
- 2 · Твърдение
- 3 · Още не е доказано
- 4 · Доказано
- 5 · Потвърдено от други
Как работи · за всички
Учените знаят реда на „мънистата“.
Програмата предлага триизмерна форма.
Формата се сравнява с измерената в лаборатория.
Източници
- [1]Jumper J., Evans R., Pritzel A. и др. (2021). Highly accurate protein structure prediction with AlphaFold. Nature 596, 583–589 · 10.1038/s41586-021-03819-2